En sistemas Linux donde por defecto hayan sido particionado las diferentes carpetas del sistema /var, /etc, /tmp con su propio espacio en disco asignado es muy común que la particion /var pueda llegar a llenarse principalmente por archivos de Mysql y/o Logs.
Algunas carpetas pueden moverse y realizar un enlace simbolico para solucionar rapida y definitivamente el problema.
1 - El primer paso es crear una carpeta dentro de una particion donde tenga espacio suficiente, en nuestro ejemplo la carpeta sera: /home/systemdata
mkdir /home/systemdata
Para mover la carpeta MYSQL
1 - Detenemos el servicio MYSQL.
cd /var/lib
service chkservd stop
service mysql stop
2 - Movemos archivos y creamos el enlace simbolico.
mv mysql /home/systemdata
ln -s /home/systemdata/mysql mysql
service mysql start
service chkservd start